中國(guó)鐵路經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院有限公司于2013年4月1日系由鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院（鐵道部工程設(shè)計(jì)鑒定中心）事業(yè)法人整體轉(zhuǎn)為企業(yè)法人，2015年2月2日完成工商注冊(cè)登記，2018年3月19日變更為“中國(guó)鐵路經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院有限公司”。

鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院（鐵道部工程設(shè)計(jì)鑒定中心）合并重組于2002年1月，是在原鐵道部工程設(shè)計(jì)鑒定中心、原鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院、原鐵路工程技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)所和原鐵路工程定額所（2004年8月并入）四個(gè)單位基礎(chǔ)上組建而來(lái)。2008年，為加快鐵路客站建設(shè)，設(shè)立內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)鐵路客站管理部；2010年，原鐵道部設(shè)立鐵路客站建設(shè)總指揮部，掛靠經(jīng)規(guī)院，2012年，為適應(yīng)鐵路改革需要，該機(jī)構(gòu)整體劃入原鐵道部工管中心。其中：
1. 原鐵道部工程設(shè)計(jì)鑒定中心。

前身是1953年鐵道部為統(tǒng)一設(shè)計(jì)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)增設(shè)的技術(shù)鑒定委員會(huì)，1955年12月更名為鐵道部設(shè)計(jì)預(yù)算鑒定委員會(huì)，是鐵道部機(jī)關(guān)的組成部分。經(jīng)歷十年文化大革命以后，1978年6月，鐵道部重新成立設(shè)計(jì)預(yù)算鑒定委員會(huì)，主要負(fù)責(zé)審查新建鐵路干線、復(fù)線、支線、樞紐、電氣化鐵路、獨(dú)立特大橋、大型客站站房及基建投資在一千五百萬(wàn)元以上的舊線、樞紐技術(shù)改造的初步設(shè)計(jì)（包括概算）。1989年7月，鐵道部建設(shè)司成立，設(shè)計(jì)鑒定委員會(huì)被撤銷，其工作納入建設(shè)司設(shè)計(jì)鑒定處。1994年6月，為適應(yīng)鐵路發(fā)展，進(jìn)一步加強(qiáng)鐵路工程設(shè)計(jì)鑒定工作，鐵道部決定成立鐵道部工程設(shè)計(jì)鑒定中心，作為部直屬事業(yè)單位，受部委托承擔(dān)部管鐵路大中型建設(shè)項(xiàng)目的設(shè)計(jì)及概算的審查鑒定工作。2002年1月1日，并入重組后的鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院。
2. 原鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院。

前身是1974年成立的交通部規(guī)劃院，1978年鐵道部與交通部分立時(shí)成立了鐵道部規(guī)劃院，開(kāi)展鐵路規(guī)劃專項(xiàng)研究工作。1991年2月，鐵道部規(guī)劃院與鐵道部科學(xué)研究院運(yùn)輸與經(jīng)濟(jì)研究所的管理經(jīng)濟(jì)和經(jīng)濟(jì)體制改革兩個(gè)研究室合并，成立了原鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院，基本職責(zé)是：為鐵路發(fā)展戰(zhàn)略、方針和目標(biāo)提供科學(xué)依據(jù)；為制訂鐵路宏觀經(jīng)濟(jì)管理的方針、政策與基本體制、制度提出建議；為編制鐵路中長(zhǎng)期規(guī)劃與進(jìn)行重大項(xiàng)目建設(shè)提出建議方案；在鐵路軟科學(xué)和對(duì)外交流方面發(fā)揮重要作用。2002年1月1日，并入重組后的鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院。
3. 原鐵路工程技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)所。

前身是1983年成立的鐵道部專業(yè)設(shè)計(jì)院規(guī)范處，主要負(fù)責(zé)鐵路工程建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)，工務(wù)工程、電力照明、修車設(shè)備產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)，標(biāo)準(zhǔn)設(shè)計(jì)，基建科研四方面管理工作，業(yè)務(wù)受原鐵道部基建總局領(lǐng)導(dǎo)。1990年1月1日，鐵道部專業(yè)設(shè)計(jì)院規(guī)范處更名為鐵道部建設(shè)司標(biāo)準(zhǔn)科情所，行政工作由鐵道部專業(yè)設(shè)計(jì)院代管，業(yè)務(wù)工作受鐵道部建設(shè)司直接領(lǐng)導(dǎo)。除負(fù)責(zé)工程建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)、三個(gè)專業(yè)產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)、標(biāo)準(zhǔn)設(shè)計(jì)、基建科研四方面管理工作之外，還承擔(dān)鐵道部下屬10余個(gè)基建情報(bào)網(wǎng)的管理工作。1998年1月1日，建設(shè)司標(biāo)準(zhǔn)科情所更名為鐵路工程技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)所，行政工作仍由鐵道部專業(yè)設(shè)計(jì)院管理，業(yè)務(wù)工作受鐵道部建設(shè)司指導(dǎo)，主要負(fù)責(zé)工程建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)、三個(gè)專業(yè)產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)、標(biāo)準(zhǔn)設(shè)計(jì)三方面管理工作。2002年1月1日，并入重組后的鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院。
4. 原鐵路工程定額所。

其前身是1984年6月成立的鐵道部基建總局概算預(yù)算定額管理所，由鐵三院代管。1989年9月更名為鐵道部建設(shè)司工程定額所，行政工作由鐵三院代管，業(yè)務(wù)工作受鐵道部建設(shè)司指導(dǎo)。1998年12月改名為鐵路工程定額所，業(yè)務(wù)工作受建設(shè)司領(lǐng)導(dǎo)，機(jī)構(gòu)設(shè)置和人員編制由所在單位確定。2003年10月改由鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院代管，業(yè)務(wù)工作由鐵道部建設(shè)司指導(dǎo)。2004年8月并入重組后的鐵道部經(jīng)濟(jì)規(guī)劃研究院，2006年變更為獨(dú)立事業(yè)單位法人機(jī)構(gòu)。